RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 OR56A1Q8NGH5 318 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 MAL2Q969L2 176 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CSF3RQ99062 836 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 BDH2Q9BUT1 245 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 C8orf4Q9NR00 106 aa11.95□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CYR61O00622 381 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 FHP07954 510 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 MSL3P1P0C860 447 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CSF2RBP32927 897 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 OLR1P78380 273 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PRR5P85299 388 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CDK6Q00534 326 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 DUSP2Q05923 314 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 USP53Q70EK8 1073 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TANKQ92844 425 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SLC35G5Q96KT7 338 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 BTBD9Q96Q07 612 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 C3orf14Q9HBI5 128 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.94□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 HYKKA2RU49 373 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 BLACEA4D250 179 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SGK494L7N484 410 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CLOCKO15516 846 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 EMC8O43402 210 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 B4GALT2O60909 372 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 DNAJB6O75190 326 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 COQ9O75208 318 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 RDH16O75452 317 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PRSS23O95084 383 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ZNF682O95780 498 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CTSBP07858 339 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 IFI6P09912 130 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 HSPA13P48723 471 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ARL4DP49703 201 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 KHKP50053 298 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 XKP51811 444 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 AQP4P55087 323 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 E2F1Q01094 437 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CFHR1Q03591 330 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TP53BP2Q13625 1128 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 GRM7Q14831 915 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 NKG7Q16617 165 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 AMZ1Q400G9 498 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TMTC4Q5T4D3 741 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 HORMAD2Q8N7B1 307 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 NAT6Q93015 286 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 TBC1D20Q96BZ9 403 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 KLHL3Q9UH77 587 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CACNA1GO43497 2377 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 FOXS1O43638 330 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 SLITRK5O94991 958 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 IFNA14P01570 189 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CDK4P11802 303 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PPP2R1BP30154 601 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 MAGEA2P43356 314 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CASP9P55211 416 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 D2HGDHQ8N465 521 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ELP4Q96EB1 424 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ZNF570Q96NI8 536 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 CIB1Q99828 191 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 BATF3Q9NR55 127 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 NTMQ9P121 344 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 DKK4Q9UBT3 224 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 AK5Q9Y6K8 562 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 ADAMTS20P59510 1910 aa11.93□□□□□ -0.5
NELFE-209ENST00000488426 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms