RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR137Q96N19 417 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM237Q96Q45 408 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RASL10BQ96S79 203 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF382Q96SR6 550 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PPCSQ9HAB8 311 aa5.94□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 HPF1Q9NWY4 346 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 AHSPQ9NZD4 102 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MYOTQ9UBF9 498 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TBK1Q9UHD2 729 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF225Q9UK10 706 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.94□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ASNA1O43681 348 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PEX1O43933 1283 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OR10H2O60403 315 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 KRT6BP04259 564 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SHBGP04278 402 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLC35E2P0CK97 266 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 GALNSP34059 522 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLCO1A2P46721 670 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 KRT6CP48668 564 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 DGKQP52824 942 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OPN5Q6U736 354 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RTL4Q6ZR62 310 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MDGA2Q7Z553 956 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TDRPQ86YL5 185 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SULF2Q8IWU5 870 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 GHDCQ8N2G8 530 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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CTDSPL-208ENST00000486978 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 DCDC2Q9UHG0 476 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC12A4Q9UP95 1085 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF6Q9Y252 685 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 RYR3Q15413 4870 aa5.92□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C1orf226A1L170 272 aa5.92□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC151A5D8V7 595 aa5.92□□□□□ -1.46
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