RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 VRK3Q8IV63 474 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 AMER2Q8N7J2 671 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NRGNQ92686 78 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPATA13Q96N96 652 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 DPH7Q9BTV6 452 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 HES7Q9BYE0 225 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NENFQ9UMX5 172 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP27XA6NNY8 438 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 VPS26AO75436 327 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSPAN9O75954 239 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZWINTO95229 277 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPANK1O95872 356 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GAS8O95995 478 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 APOC2P02655 101 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TPOP07202 933 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLK2P20151 261 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCR7P32248 378 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 BSGP35613 385 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 BDKRB1P46663 353 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 IST1P53990 364 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDH15P55291 814 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 EPS8Q12929 822 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBA3CQ13748 450 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NAA25Q14CX7 972 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCM1Q15154 2024 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 RASA2Q15283 850 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MEP1AQ16819 746 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADCK2Q7Z695 626 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LUZP1Q86V48 1076 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT222Q8N1A0 295 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2L3Q8NG85 312 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACTL9Q8TC94 416 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM136AQ96C01 138 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAR2Q96K12 515 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 C10orf90Q96M02 699 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC42Q96M95 316 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOPNLQ96NB1 174 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 UCK2Q9BZX2 261 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 DRC3Q9H069 523 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ALG6Q9Y672 507 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTORP42345 2549 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT87PA6NCN2 255 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GABRR3A8MPY1 467 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms