RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CEP170P1Q96L14 293 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 DOK1Q99704 481 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 TSG101Q99816 390 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 C17orf62Q9BQA9 187 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 NANOGQ9H9S0 305 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNK13Q9HB14 408 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 NENFQ9UMX5 172 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 ZHX2Q9Y6X8 837 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 NFAT5O94916 1531 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 DCCP43146 1447 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-210ENST00000485459 PSME4Q14997 1843 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CPS1P31327 1500 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CLDN25C9JDP6 229 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 I3L4J1 428 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NDUFS4O43181 175 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NDUFA2O43678 99 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TYROBPO43914 113 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 OR7A10O76100 309 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MFN2O95140 757 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 HLA-DRAP01903 254 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 DNTTP04053 509 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SELLP14151 372 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 BGNP21810 368 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NMBRP28336 390 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 RRM2P31350 389 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 OPRL1P41146 370 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNJ1P48048 391 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 RAD23AP54725 363 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CDH8P55286 799 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 S100A12P80511 92 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CDC20Q12834 499 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CDK10Q15131 360 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 IL17AQ16552 155 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CARTPTQ16568 116 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 JADE1Q6IE81 842 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CENPPQ6IPU0 288 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC22A16Q86VW1 577 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CATSPER3Q86XQ3 398 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF383Q8NA42 475 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LEMD2Q8NC56 503 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 IPMKQ8NFU5 416 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5H6Q8NGV6 325 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 S100ZQ8WXG8 99 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 C9orf72Q96LT7 481 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00479Q96M42 142 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF560Q96MR9 790 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 PLIN2Q99541 437 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-210ENST00000485459 CHID1Q9BWS9 393 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms