RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 UCN3Q969E3 161 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 FUT8Q9BYC5 575 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 SLC6A15Q9H2J7 730 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 SPRR3Q9UBC9 169 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 Q9UFV3 132 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 C1orf226A1L170 272 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD33BA6NCL7 494 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TRPC1P48995 793 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 FBXW4P57775 412 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 RTL6Q6ICC9 239 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TMEM64Q6YI46 380 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 METTL4Q8N3J2 472 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 LRRC3CA6NJW4 275 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 HSPB2A8KAH6 182 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 AHRRA9YTQ3 701 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TRIM49D1C9J1S8 452 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CDH16O75309 829 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CLPSP04118 112 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CPMP14384 443 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 MAGEA12P43365 314 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 FUT7Q11130 342 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TRAF3Q13114 568 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 DUSP8Q13202 625 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 HSPB2Q16082 182 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 MMGT1Q8N4V1 131 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 SPPL2AQ8TCT8 520 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ISL2Q96A47 359 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 RILPQ96NA2 401 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PROK2Q9HC23 129 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ZNF180Q9UJW8 692 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ESRRBO95718 433 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CT62P0C5K7 136 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TAC1P20366 129 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 GCKP35557 465 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PEX19P40855 299 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ALDH9A1P49189 494 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 COMMD6Q7Z4G1 85 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ULK2Q8IYT8 1036 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 VWA5B2Q8N398 1253 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ZNF615Q8N8J6 731 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ZNF441Q8N8Z8 693 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 C17orf47Q8NEP4 570 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 METTL7AQ9H8H3 244 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 BRF2Q9HAW0 419 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PS29 197 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 DVL2O14641 736 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PDYNP01213 254 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 RPS17P08708 135 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 FREM3P0C091 2139 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CTAGE8P0CG41 777 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ADH7P40394 386 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CDH13P55290 713 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 SLC48A1Q6P1K1 146 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ARSKQ6UWY0 536 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PRR22Q8IZ63 422 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 KLHL29Q96CT2 875 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ANGPTL4Q9BY76 406 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TRPS1Q9UHF7 1281 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 IL2RAP01589 272 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 KRT6AP02538 564 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 KRT6BP04259 564 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN8P19075 237 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 UQCRC1P31930 480 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 FEN1P39748 380 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 KRT6CP48668 564 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 LIX1LQ8IVB5 337 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-212ENST00000484841 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.47■□□□□ 0.55
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