RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483605.5

SUCLG1-204, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-204	ENST00000483605	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	UBE2E3	Q969T4	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MBD6	Q96DN6	1003 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ART5	Q96L15	291 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	PHF11	Q9UIL8	331 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605		A0A1B0GTL3	188 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	CLCA1	A8K7I4	914 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605		B4DXG7	233 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	RAD51C	O43502	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	DYRK3	O43781	588 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	HRG	P04196	525 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	SLC35E2	P0CK97	266 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	EPB42	P16452	691 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	CD53	P19397	219 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	CTSS	P25774	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	HOXC12	P31275	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	PIK3CB	P42338	1070 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MASP1	P48740	699 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GNG11	P61952	73 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	SRY	Q05066	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MGAT2	Q10469	447 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	FUT7	Q11130	342 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	KEAP1	Q14145	624 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	TAGAP	Q8N103	731 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	FBF1	Q8TES7	1133 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605		H0YIV9	168 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	OR7A17	O14581	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	TP53I11	O14683	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	SIAH2	O43255	324 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	KLK1	P06870	262 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	NT5E	P21589	574 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GPX3	P22352	226 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	CNTF	P26441	200 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ABCD3	P28288	659 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	XK	P51811	444 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GTF2H2	Q13888	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	CDKL2	Q92772	493 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	HGD	Q93099	445 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	GPR78	Q96P69	363 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ITPA	Q9BY32	194 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	IPPK	Q9H8X2	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-204	ENST00000483605	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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