RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AIRE	O43918	545 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANGPTL1	O95841	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ACP5	P13686	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	POU2F1	P14859	743 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DPT	Q07507	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C12orf57	Q99622	126 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLPP1	O14494	284 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM20B	O75063	409 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF254	O75437	659 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF806	P0C7X5	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FGL2	Q14314	439 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM124A	Q86V42	546 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GANC	Q8TET4	914 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	REEP1	Q9H902	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MALT1	Q9UDY8	824 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DNAJB5	O75953	348 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PAH	P00439	452 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IFNA14	P01570	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LCK	P06239	509 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IL1RN	P18510	177 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C21orf58	P58505	322 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DOK1	Q99704	481 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BTBD2	Q9BX70	525 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC16A6	O15403	523 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FPR1	P21462	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SCARB2	Q14108	478 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CST6	Q15828	149 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	REPS1	Q96D71	796 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COX14	Q96I36	57 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EMC3	Q9P0I2	261 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1W2PRB8	838 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTDSP2	O14595	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	POU2F2	P09086	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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