RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 CRATP43155 626 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 GZMMP51124 257 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 NHLH1Q02575 133 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 TP53BP2Q13625 1128 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FAM110BQ8TC76 370 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 TSLPQ969D9 159 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 LANCL2Q9NS86 450 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 MPIP34949 423 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ARSFP54793 590 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 OR7G2Q8NG99 324 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 EQTNQ9NQ60 294 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 SPTBN2O15020 2390 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 A8MUA0 341 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 BMP10O95393 424 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CCKBRP32239 447 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 EMP3P54852 163 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 RGNQ15493 299 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 RAB8BQ92930 207 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CMKLR1Q99788 373 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PISDQ9UG56 409 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ZFHX4Q86UP3 3567 aa16.94■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GVG6 124 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FGF5P12034 268 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ATP6V1B2P21281 511 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 NT5EP21589 574 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 MC2RQ01718 297 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 STX4Q12846 297 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 DSG2Q14126 1118 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CEBPEQ15744 281 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 GPR155Q7Z3F1 870 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 RNF217Q8TC41 542 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 TANKQ92844 425 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ELP4Q96EB1 424 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 V9GYQ6 96 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 KCNK5O95279 499 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FTH1P19P0C7X4 201 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 UQCRC2P22695 453 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 E2F1Q01094 437 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ABHD18Q0P651 414 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 APOFQ13790 326 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 MLIPQ5VWP3 458 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 OR2T12Q8NG77 320 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 EVPLLA8MZ36 301 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PROB1E7EW31 1015 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 UPK1AO00322 258 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CTNSO60931 367 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 HSD17B1P14061 328 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ETS2P15036 469 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 GPX2P18283 190 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 SKP1P63208 163 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CYP51A1Q16850 503 aa16.92■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms