RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464362.5

HPS4-208, Transcript of HPS4, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene HPS4, Length 4,277 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4-208ENST00000464362 DSG2Q14126 1118 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 KCNJ8Q15842 424 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 AMZ1Q400G9 498 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CBLL1Q75N03 491 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 AGAP5A6NIR3 686 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 B4DGG1 531 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GFRA2O00451 464 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 FAAHO00519 579 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GPR37L1O60883 481 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CCL5P13501 91 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PTGS2P35354 604 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 LIPAP38571 399 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GSTM4Q03013 218 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ADAM15Q13444 863 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 KCNC3Q14003 757 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CST9Q5W186 159 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 RPTNQ6XPR3 784 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 SERPINA11Q86U17 422 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 INSL6Q9Y581 213 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 KMOO15229 486 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 KCNK5O95279 499 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 HSD3B1P14060 373 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 HSD3B2P26439 372 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 RAB33AQ14088 237 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GPR135Q8IZ08 494 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 DEFB119Q8N690 84 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ELOA3Q8NG57 546 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 KATNBL1Q9H079 304 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CENPMQ9NSP4 180 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 SPTBP11277 2137 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 A0A1W2PQ09 198 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ADAMTS4O75173 837 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 OR2B3O76000 313 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ZNF3P17036 446 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 TNFSF8P32971 234 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 NRIP1P48552 1158 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PYCR3Q53H96 274 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 MUL1Q969V5 352 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 RLIMQ9NVW2 624 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 MARCH5Q9NX47 278 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 SLC16A5O15375 505 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 NUAK1O60285 661 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GYPBP06028 91 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 OSMP13725 252 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GNSP15586 552 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 LHCGRP22888 699 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GABRA3P34903 492 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 GMFBP60983 142 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 VEZF1Q14119 521 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS4-208ENST00000464362 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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