RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5EP21589 574 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNSP34059 522 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MEOX1P50221 254 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP16P51512 607 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SSR4P51571 173 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 HSF1Q00613 529 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PLIN5Q00G26 463 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf80Q0P641 193 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP4K2Q12851 820 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 BIKQ13323 160 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP157Q5JU67 520 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 KANK2Q63ZY3 851 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ATCAYQ86WG3 371 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR22Q8IZ63 422 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM156Q8N614 296 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 BCORP1Q8N888 145 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8K3Q8NH51 312 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 NUBPLQ8TB37 319 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 AGR3Q8TD06 166 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB15Q8WXK1 588 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 KAT2AQ92830 837 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 NTNG2Q96CW9 530 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 FCRL1Q96LA6 429 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10A5Q9H207 317 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 MED12LQ86YW9 2145 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MVJ9 347 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 B4DXG7 233 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PIP5K1BO14986 540 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX1O43933 1283 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HS6ST1O60243 411 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 STSP08842 583 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPH2P23942 346 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 COL8A1P27658 744 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGAP37287 484 aa6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 DNASE1L1P49184 302 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EMDP50402 254 aa6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXO1Q12778 655 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CEBPEQ15744 281 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 INAQ16352 499 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 IMPG1Q17R60 797 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIN4Q56A73 249 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FHL5Q5TD97 284 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BICRALQ6AI39 1079 aa6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 GFRALQ6UXV0 394 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2M7Q8NG81 312 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL8AQ96BM9 186 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL29Q96CT2 875 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR137Q96N19 417 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SMC6Q96SB8 1091 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SORT1Q99523 831 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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