RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 C6orf163Q5TEZ5 329 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SLC22A10Q63ZE4 541 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF787Q6DD87 383 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 GALNT18Q6P9A2 607 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 RPTNQ6XPR3 784 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 VWA5B2Q8N398 1253 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 OR7G1Q8NGA0 311 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 OR10G3Q8NGC4 313 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ADIPOR1Q96A54 375 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF681Q96N22 645 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PHF12Q96QT6 1004 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB127Q9H1M4 99 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 MAT2BQ9NZL9 334 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PSME2Q9UL46 239 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 MEMO1Q9Y316 297 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ACOT7O00154 380 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PDE9AO76083 593 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINB3P29508 390 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.082e-6■□□□□ 10.8
HOXB3-202ENST00000460160 PTGS2P35354 604 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 LIPMQ5VYY2 423 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 WDR93Q6P2C0 686 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 EMBQ6PCB8 327 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 FAM111BQ6SJ93 734 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM64Q6YI46 380 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 MRGPRGQ86SM5 289 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TRABD2AQ86V40 505 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SLC22A16Q86VW1 577 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TAGAPQ8N103 731 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 FAM13CQ8NE31 585 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TP53INP1Q96A56 240 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 MKS1Q9NXB0 559 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 DTX4Q9Y2E6 619 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 APCP25054 2843 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 H3BQF6 201 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PRRG2O14669 202 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 DRD2P14416 443 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 BTKQ06187 659 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 MAP4K2Q12851 820 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PCLAFQ15004 111 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 NTRK2Q16620 822 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM251Q8N6I4 163 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 BANPQ8N9N5 519 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ADCY4Q8NFM4 1077 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 C16orf78Q8WTQ4 265 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 APOPT1Q96IL0 206 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 EBPLQ9BY08 206 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 BRINP2Q9C0B6 783 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PROK2Q9HC23 129 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SIRT5Q9NXA8 310 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF639Q9UID6 485 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PLLPQ9Y342 182 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ADAM10O14672 748 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 GPX3P22352 226 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 DUSP8Q13202 625 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 LTB4RQ15722 352 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 HYAL4Q2M3T9 481 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 PRAMEF20Q5VT98 475 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 C3P1Q6ZMU1 363 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SIMC1Q8NDZ2 872 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 FAM57AQ8TBR7 257 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 CTHRC1Q96CG8 243 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 MID2Q9UJV3 735 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TACC2O95359 2948 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 CRCPO75575 148 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEA5P43359 124 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 ART3Q13508 389 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 SPDYAQ5MJ70 313 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM46Q7Z4K8 759 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 FAM109AQ8N4B1 249 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 C17orf47Q8NEP4 570 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 OR5M3Q8NGP4 307 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 CAVIN3Q969G5 261 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 CNIH4Q9P003 139 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-202ENST00000460160 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms