RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ART5Q96L15 291 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF681Q96N22 645 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MASP2O00187 686 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 AKAP10O43572 662 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CEACAM4O75871 244 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 LRATO95237 230 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ITGA3P26006 1051 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 HPCAL1P37235 193 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 IDH3AP50213 366 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 AQP5P55064 265 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CLDN8P56748 225 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXK1P85037 733 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 Q0VFX4 171 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PDE7AQ13946 482 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FITM2Q8N6M3 262 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 STON2Q8WXE9 905 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RIT1Q92963 219 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PPCDCQ96CD2 204 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 BBS4Q96RK4 519 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 A6NL46 340 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJB5O75953 348 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP1B1P05026 303 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MPIP34949 423 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DIO3P55073 304 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 C21orf58P58505 322 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MYBPC3Q14896 1274 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PTGR1Q14914 329 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CEBPEQ15744 281 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NATD1Q8N6N6 113 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 VMP1Q96GC9 406 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52B2Q96RD2 323 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SPTA1P02549 2419 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GABRR3A8MPY1 467 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DDAH2O95865 285 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NT5EP21589 574 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NTSP30990 170 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CLCN2P51788 898 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR143P51810 404 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PGDP52209 483 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS6KA2Q15349 733 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ELP5Q8TE02 316 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NCLNQ969V3 563 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DPY30Q9C005 99 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8D2Q9GZM6 311 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNK13Q9HB14 408 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NPHS2Q9NP85 383 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 AIG1Q9NVV5 245 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR83Q9NYM4 423 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PS29 197 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 UBDO15205 165 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CELA2AP08217 269 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ITGAMP11215 1152 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 IDO1P14902 403 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP4K2Q12851 820 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 KLRB1Q12918 225 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTA3Q16772 222 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CPTPQ5TA50 214 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms