RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-209ENST00000441099 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 CASP8Q14790 479 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 XKR7Q5GH72 579 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 SIAH3Q8IW03 269 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 DDIASQ8IXT1 998 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRR7Q8TB68 274 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TLCD1Q96CP7 247 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 EGLN2Q96KS0 407 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 SGCZQ96LD1 299 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 DEPPQ9NTK1 212 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 SEMA7AO75326 666 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 FBXO45P0C2W1 286 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 PCSK2P16519 638 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 MEOX1P50221 254 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 FHL5Q5TD97 284 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 RTL4Q6ZR62 310 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF675Q8TD23 568 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TP53INP1Q96A56 240 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 C3orf30Q96M34 536 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TMEM120BA0PK00 339 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 TMEM114B3SHH9 223 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 HSPA4LO95757 839 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCL3P10147 92 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 SDC1P18827 310 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 BGNP21810 368 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GPX3P22352 226 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GRK2P25098 689 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 MPIP34949 423 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC18A1P54219 525 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 KCNK10P57789 538 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GPR85P60893 370 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GALNTL6Q49A17 601 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GFRALQ6UXV0 394 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 BBS4Q96RK4 519 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCT7Q99832 543 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 A0A0G2JMM0 328 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 A0A1W2PPB8 328 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 A0A1W2PRS3 328 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 PINLYPA6NC86 204 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 PEX11AO75192 247 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 UNC5CO95185 931 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 CNR1P21554 472 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC1A6P48664 564 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 EMDP50402 254 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 STX3Q13277 289 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 TMEM64Q6YI46 380 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms