RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 TGFBIQ15582 683 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ZSCAN26Q16670 478 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 FAM153CQ494X1 144 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 DCST1Q5T197 706 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 STEAP4Q687X5 459 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 LAS2Q8IYD9 372 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TAGAPQ8N103 731 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 FAM13CQ8NE31 585 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 WNT2BQ93097 391 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 VPS39Q96JC1 886 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 Q96MF0 132 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 GNRHR2Q96P88 292 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TRIB1Q96RU8 372 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PIGMQ9H3S5 423 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 WWOXQ9NZC7 414 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CAPN14A8MX76 684 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CASKO14936 926 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SIAH2O43255 324 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CDH16O75309 829 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CRLF1O75462 422 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 BANF1O75531 89 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 STK16O75716 305 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 LRATO95237 230 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 GPR75O95800 540 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 NUDT17P0C025 328 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 FPR1P21462 350 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CPN2P22792 545 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 IVDP26440 423 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PTPN6P29350 595 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ECHS1P30084 290 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SERPINB1P30740 379 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SOX18P35713 384 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 MC3RP41968 323 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 CASP3P42574 277 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PLTPP55058 493 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TAS2R39P59534 338 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PPP2R2BQ00005 443 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SLAMF1Q13291 335 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 RCAN2Q14206 197 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 POU4F3Q15319 338 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 RPS6KA2Q15349 733 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ACKR1Q16570 336 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 KRT71Q3SY84 523 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 EIPR1Q53HC9 387 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 GPR180Q86V85 440 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 PACS2Q86VP3 889 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 DIO2Q92813 273 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 UBE2E3Q969T4 207 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 LRRC39Q96DD0 335 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 MARK4Q96L34 752 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 RILPQ96NA2 401 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 TM9SF2Q99805 663 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00578-201ENST00000439009 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms