RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.05□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 HHATLQ9HCP6 504 aa13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.05□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 ERP29P30040 261 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 SLC7A13Q8TCU3 470 aa13.04□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 REM1O75628 298 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 PNLIPRP1P54315 467 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 C11orf88Q6PI97 169 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 AMZ2Q86W34 360 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 FIBINQ8TAL6 211 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 H0YIV9 168 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 NUDT15Q9NV35 164 aa13.03□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 CHST10O43529 356 aa13.02□□□□□ -0.32
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SGMS1-203ENST00000429490 ETV5P41161 510 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 XCR1P46094 333 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 ETV1P50549 477 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 ID2Q02363 134 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 SEC23BQ15437 767 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 FAM205BPQ63HN1 556 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 ANKRD54Q6NXT1 300 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.02□□□□□ -0.32
SGMS1-203ENST00000429490 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
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