RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428401.1

AC005300.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC005300.1, Length 373 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AC005300.1-201ENST00000428401 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.16□□□□□ -1.9
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