RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ZNF487B1APH4 448 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ZNF253O75346 499 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 KBTBD11O94819 623 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 UCP1P25874 307 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 NT5C2P49902 561 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CSRP3P50461 194 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 NDST1P52848 882 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 PEX6Q13608 980 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HKDC1Q2TB90 917 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 LUZP1Q86V48 1076 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 BIRC7Q96CA5 298 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CUTCQ9NTM9 273 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 FETUBQ9UGM5 382 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 RNF24Q9Y225 148 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.27□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 E2F3O00716 465 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 NME2P1O60361 137 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 LRP3O75074 770 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SYNGR4O95473 234 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 PIGRP01833 764 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SLC7A2P52569 658 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 IST1P53990 364 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HMGCS2P54868 508 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CARTPTQ16568 116 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HAGHQ16775 308 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 KRT71Q3SY84 523 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ACER2Q5QJU3 275 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 APOOLQ6UXV4 268 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 MOB2Q70IA6 237 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A16Q86VW1 577 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 LEMD2Q8NC56 503 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 EXOC6Q8TAG9 804 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 P3H4Q92791 437 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ACCSQ96QU6 501 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V0BQ99437 205 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 APOL2Q9BQE5 337 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 TNMDQ9H2S6 317 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 THAP9Q9H5L6 903 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 NRN1Q9NPD7 142 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 HPS4Q9NQG7 708 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 MLXQ9UH92 298 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 AGRNO00468 2067 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 A0A0A6YYD4 124 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 PHOX2AO14813 284 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 RPL34P49207 117 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CCL11P51671 97 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 MFAP2P55001 183 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 LTB4RQ15722 352 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 RNLSQ5VYX0 342 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 Q6ZR54 194 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 NAXDQ8IW45 347 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 PYROXD2Q8N2H3 581 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 CCNYQ8ND76 341 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 URGCPQ8TCY9 931 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 TBCKQ8TEA7 893 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 DEFB118Q96PH6 123 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 NLNQ9BYT8 704 aa3.25□□□□□ -1.89
RBM39-211ENST00000426951 ZBP1Q9H171 429 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms