RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBWD3Q5JTY5 395 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 METTL11BQ5VVY1 283 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4C11Q6IEV9 310 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC5CLQ8IV45 518 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TXLNBQ8N3L3 684 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO39Q8N4B4 442 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC33Q8N5R6 958 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLD5Q8N7P1 536 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10S1Q8NGN2 331 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 POMGNT1Q8WZA1 660 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIGBQ92521 554 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 AIFM3Q96NN9 605 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRRT1Q99946 306 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNMDQ9H2S6 317 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NT5DC2Q9H857 520 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH3GLB2Q9NR46 395 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 STARD5Q9NSY2 213 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAS2R1Q9NYW7 299 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATG4BQ9Y4P1 393 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 R4GN34 69 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPACA6W5XKT8 324 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL6A3P12111 3177 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GUH1 482 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYBPHLA2RUH7 354 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 POM121BA6NF01 834 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBXN8O00124 270 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOL1O14791 398 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 AQP9O43315 295 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANGPTL1O95841 491 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 YES1P07947 543 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC159P0C7I6 412 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 INAFM2P0DMQ5 153 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PF4V1P10720 104 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 GZMAP12544 262 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 FEN1P39748 380 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPMTP51580 245 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALDH3A2P51648 485 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFAP2P55001 183 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFNB1P98172 346 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2orf54Q08AI8 447 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBBP4Q09028 425 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAA25Q14CX7 972 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSDHLQ15738 373 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CA9Q16790 459 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALG11Q2TAA5 492 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 UGT3A2Q3SY77 523 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ODF2Q5BJF6 829 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPTPQ5TA50 214 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYT13Q7L8C5 426 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR86Q86TI4 376 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOGAT3Q86VF5 341 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMD2Q8IY49 270 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC1AQ8NC01 280 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5W2Q8NH69 310 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOSPD2Q8NHP6 518 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRPC4APQ8TEL6 797 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCFD2Q8WU76 684 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM151AQ8WW52 585 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF14Q92956 283 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGGYQ96C11 551 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM68Q96MH6 324 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAAR1Q96RJ0 339 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMM29Q9BSF4 260 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 HGH1Q9BTY7 390 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEMGNQ9BXL5 484 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM9Q9C026 710 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 XKR8Q9H6D3 395 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED4Q9NPJ6 270 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO8Q9NRD0 319 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALKBH4Q9NXW9 302 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHCGQ9UBD6 479 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPB7Q9UBY9 170 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 PILRBQ9UKJ0 227 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNPEPQ9ULA0 475 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa-1.56□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms