RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 DMTF1Q9Y222 760 aa6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 OR1A2Q9Y585 309 aa6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TACC2O95359 2948 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRSS38A1L453 326 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PIPSLA2A3N6 862 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 E7ENX8 843 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 VILLO15195 856 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 MYO1DO94832 1006 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SEMA3DO95025 777 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CCNDBP1O95273 360 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SEMA4FO95754 770 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CLDN1O95832 211 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PDYNP01213 254 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 IL6P05231 212 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 IGHV4-34P06331 123 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ACP5P13686 325 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SDC1P18827 310 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CD22P20273 847 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 BMP5P22003 454 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 IDSP22304 550 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CXCR2P25025 360 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CD27P26842 260 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 NDUFS1P28331 727 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 OXTRP30559 389 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PKLRP30613 574 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 AKT2P31751 481 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 GCKP35557 465 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PIK3CBP42338 1070 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ASMTP46597 345 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 RAB28P51157 221 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CCR5P51681 352 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SLC7A2P52569 658 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 YPEL5P62699 121 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 REEP5Q00765 189 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HMGCS1Q01581 520 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TAP2Q03519 686 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SLC34A1Q06495 639 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CEACAM7Q14002 265 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CCNIQ14094 377 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 DOC2AQ14183 400 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 KIAA0040Q15053 153 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PYCR3Q53H96 274 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 IL23RQ5VWK5 629 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HPS6Q86YV9 775 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 LAS2Q8IYD9 372 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 KRT78Q8N1N4 520 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 LIX1Q8N485 282 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SMPDL3AQ92484 453 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 NEIL2Q969S2 332 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HBEGFQ99075 208 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 APOOQ9BUR5 198 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 DPY30Q9C005 99 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 FGF22Q9HCT0 170 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ADA2Q9NZK5 511 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PR77 199 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 KRT87PA6NCN2 255 aa6.19□□□□□ -1.42
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