RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CD8B2A6NJW9 211 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LRRTM2O43300 516 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FMO6PO60774 539 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LATS1O95835 1130 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 S1PR4O95977 384 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CD8BP10966 210 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CARM1Q86X55 608 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 HRH2P25021 359 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CA5AP35218 305 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RAB8AP61006 207 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PNCKQ6P2M8 343 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CRYZL1O95825 349 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 DRD5P21918 477 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 S100A7AQ86SG5 101 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GKN2Q86XP6 184 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 LRR1Q96L50 414 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 SLC16A8O95907 504 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 PYCR1P32322 319 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DCTP40126 519 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ADH7P40394 386 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PREPP48147 710 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HTR6P50406 440 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ8Q15842 424 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 EOGTQ5NDL2 527 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KIF18BQ86Y91 864 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SPARTQ8N0X7 666 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 PFKMP08237 780 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 IL4RP24394 825 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 S100A7P31151 101 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ACVR1BP36896 505 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.47□□□□□ -1.05
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