RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMER2Q8N7J2 671 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TP53INP1Q96A56 240 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRODH2Q9UF12 536 aa14.19□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CT62P0C5K7 136 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KITP10721 976 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 G6PDP11413 515 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSTR4P31391 388 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD96P40200 585 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP2Q05923 314 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLC1Q15049 377 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGGQ5H8A4 983 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OPN5Q6U736 354 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASL10BQ96S79 203 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRFN1Q9P244 771 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAN1A2O60476 641 aa14.17□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRATO95237 230 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF7P61962 342 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTGR1Q14914 329 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1C1Q15619 314 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAGAPQ8N103 731 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8NA96 180 aa14.17□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.17□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTLL8A6PVC2 850 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A8MVJ9 347 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAPN14A8MX76 684 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WWP2O00308 870 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF195O14628 629 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEURL1O76050 574 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBX7O95931 251 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPHA3P29320 983 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOX18P35713 384 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIO3P55073 304 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRG3P56975 720 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LTB4RQ15722 352 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACAD11Q709F0 780 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.16□□□□□ -0.14
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