RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SCRN2Q96FV2 425 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SARGQ9BW04 601 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 GABRPO00591 440 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 OR10H3O60404 316 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SEMA7AO75326 666 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SLC6A4P31645 630 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SOX18P35713 384 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SLC6A12P48065 614 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 EFNB1P98172 346 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 DSC1Q08554 894 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 OR4K3Q96R72 315 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.61■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 HLA-DPB1P04440 258 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LIMS3P0CW19 117 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LIMS4P0CW20 117 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 OR12D1P0DN82 309 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 DRD2P14416 443 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RFX3P48380 749 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RAB40BQ12829 278 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 MBTPS1Q14703 1052 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 CLRN3Q8NCR9 226 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 BEST4Q8NFU0 473 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 MYO19Q96H55 970 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SPON2Q9BUD6 331 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 KATNBL1Q9H079 304 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 MAGEH1Q9H213 219 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 CD93Q9NPY3 652 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LGALS8O00214 317 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 B3GAT3O94766 335 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 FGF2P09038 288 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 JUPP14923 745 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RAG2P55895 527 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 NR2C2APQ86WQ0 139 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 KCT2Q8NC54 265 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 TMED9Q9BVK6 235 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 OR51B5Q9H339 312 aa20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 INPPL1O15357 1258 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RGS11O94810 467 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ACP2P11117 423 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 DCST1Q5T197 706 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 MACC1Q6ZN28 852 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ASPGQ86U10 573 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 GPR135Q8IZ08 494 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LPPQ93052 612 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ASIC4Q96FT7 647 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 CBLCQ9ULV8 474 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ABCD4O14678 606 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 PEPDP12955 493 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 GIFP27352 417 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 PITPNBP48739 271 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 RAB8AP61006 207 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 COX10Q12887 443 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 MPEG1Q2M385 716 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 NLRC3Q7RTR2 1065 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 OAFQ86UD1 273 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 OXR1Q8N573 874 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 ASB8Q9H765 288 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.59■□□□□ 0.89
OPN3-201ENST00000366554 HPF1Q9NWY4 346 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms