RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NEIL2Q969S2 332 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MYRFLQ96LU7 910 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BTNL2Q9UIR0 455 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BTAF1O14981 1849 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PRLHRP49683 370 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 POU4F2Q12837 409 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 IRF4Q15306 451 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf46Q504U0 113 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX26Q8N6G2 289 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SGCDQ92629 289 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1F2PQ96R84 312 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZIC5Q96T25 663 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CWH43Q9H720 699 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CCR7P32248 378 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A11P48066 632 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2B6P58173 313 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVFC1P60507 584 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TAZQ16635 292 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RAET1LQ5VY80 246 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TRNP1Q6NT89 227 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PNPLA1Q8N8W4 532 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP76Q8TAP6 659 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 THAP4Q8WY91 577 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TAMM41Q96BW9 452 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBP1Q9H171 429 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 F11P03951 625 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 P04436 131 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPN3P20807 821 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 INHBCP55103 352 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ODF4Q2M2E3 257 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DIO2Q92813 273 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 H2BFMP0C1H6 154 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MYH8P13535 1937 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MLLT10P55197 1068 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR14I1A6ND48 311 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DDCP20711 480 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HK3P52790 923 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GAS6Q14393 721 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGGQ5H8A4 983 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF675Q8TD23 568 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 XPNPEP2O43895 674 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CLPXO76031 633 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PRLP01236 227 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RETP07949 1114 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 AOAHP28039 575 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CDKL1Q00532 357 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RGNQ15493 299 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CD6P30203 668 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 EURLQ9NYK6 297 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 ANTXRLA6NF34 631 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 NME4O00746 187 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP4-201ENST00000344528 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms