RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PADI4Q9UM07 663 aa5.73□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JN53 185 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 FUOMA2VDF0 154 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 FXYD1O00168 92 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TRIM38O00635 465 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 GOSR1O95249 250 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SLC35G6P0C7Q6 338 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 IFI30P13284 250 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SSR2P43308 183 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 GSTM5P46439 218 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 BCAP31P51572 246 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 MAPK12P53778 367 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 NR0B2Q15466 257 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 CPTPQ5TA50 214 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 GPR180Q86V85 440 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 OR8J2Q8NGG1 315 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 NCSTNQ92542 709 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ITCHQ96J02 903 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TGM7Q96PF1 710 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K3Q99759 626 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 RNF24Q9Y225 148 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ACOD1A6NK06 481 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 H0YGG7 62 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 AP3D1O14617 1153 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS11DO60235 418 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 MAN1A2O60476 641 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 IFNA16P05015 189 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SYPP08247 313 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 FURINP09958 794 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PF4V1P10720 104 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 LAMP1P11279 417 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TNNI3P19429 210 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 KIR3DL1P43629 444 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 GFERP55789 205 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 WNT3P56703 355 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ACTR3P61158 418 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 MC1RQ01726 317 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TGM3Q08188 693 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PDE7AQ13946 482 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 CEACAM7Q14002 265 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SSX2Q16385 188 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 AMER3Q8N944 861 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 Q8NFD4 153 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 COQ8BQ96D53 544 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 MTERF3Q96E29 417 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TCTN2Q96GX1 697 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 DUSP26Q9BV47 211 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SERHLQ9NQF3 203 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 ABCD2Q9UBJ2 740 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SESN1Q9Y6P5 492 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 LAMA1P25391 3075 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 DMDP11532 3685 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TLCD2A6NGC4 264 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 TTLL8A6PVC2 850 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 A8MU76 341 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PDPK1O15530 556 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 PROM1O43490 865 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 B4GAT1O43505 415 aa5.72□□□□□ -1.49
CCR6-201ENST00000341935 SIGLEC6O43699 453 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms