RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 HSD11B2P80365 405 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 OR14L1PQ8NHC6 308 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ASB15Q8WXK1 588 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 HTRA3P83110 453 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 FADDQ13158 208 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 TIGD4Q8IY51 512 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 STARD5Q9NSY2 213 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 C14orf119Q9NWQ9 140 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 REV1Q9UBZ9 1251 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 LIPT1Q9Y234 373 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 C16orf78Q8WTQ4 265 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 KCNN3Q9UGI6 736 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SLITRK5O94991 958 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 CA3P07451 260 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 SYPP08247 313 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 GGT3PA6NGU5 568 aa21.33■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.33■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 HSD3B1P14060 373 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 DRD2P14416 443 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 OR4K13Q8NH42 304 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF442Q9H7R0 627 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CWH43Q9H720 699 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 BRINP1O60477 761 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-201ENST00000332175 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 SPEF2Q9C093 1822 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RBBP9O75884 186 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 RHCEP18577 417 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 CRISP1P54107 249 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ACTC1P68032 377 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 ACTA1P68133 377 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-201ENST00000332175 MLC1Q15049 377 aa21.31■■□□□ 1
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