RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C7orf34Q96L11 122 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 BBS4Q96RK4 519 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DPH7Q9BTV6 452 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TIGARQ9NQ88 270 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GPR83Q9NYM4 423 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CTDSP2O14595 271 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PDPK1O15530 556 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 VEGFDO43915 354 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL18O94889 574 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 HSD3B1P14060 373 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 HSD3B2P26439 372 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 EVI2BP34910 448 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CTSKP43235 329 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 MVDP53602 400 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RAB25P57735 213 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PPP2CBP62714 309 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PPP2CAP67775 309 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 HOXC5Q00444 222 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 FBXL6Q8N531 539 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DNASE1L2Q92874 299 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 COQ8BQ96D53 544 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM19Q96HH6 336 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR51E2Q9H255 320 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LTBP2Q14767 1821 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CFAP54Q96N23 3096 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 M0R3H8 397 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR10H3O60404 316 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GADD45GO95257 159 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NTN1O95631 604 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 FHP07954 510 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NR2F1P10589 423 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 FCARP24071 287 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GRK3P35626 688 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OLR1P78380 273 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LRRC32Q14392 662 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CCDC120Q96HB5 630 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 FGF22Q9HCT0 170 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 USE1Q9NZ43 259 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 AHSPQ9NZD4 102 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PGRMC2O15173 223 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TNFRSF21O75509 655 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GABARAPO95166 117 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RASGRP1O95267 797 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 EML2O95834 649 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TNNI3P19429 210 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LIPAP38571 399 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ERVK-21P61565 698 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GPLD1P80108 840 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GPR19Q15760 415 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 METRNLQ641Q3 311 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C18orf63Q68DL7 685 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SETD9Q8NE22 299 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PJA1Q8NG27 643 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms