RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 MMP25Q9NPA2 562 aa22.02■■□□□ 1.12
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RAB20-201ENST00000267328 EMC8O43402 210 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB20-201ENST00000267328 PRAMEF2O60811 474 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB20-201ENST00000267328 PSMG1O95456 288 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB20-201ENST00000267328 CDKN2CP42773 168 aa21.97■■□□□ 1.11
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