RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 IgfalsP70389 603 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Defb33Q30KN3 62 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Apobec4Q497M3 374 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Klhl13Q80TF4 654 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rnd1Q8BLR7 232 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 EtfdhQ921G7 616 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 FetubQ9QXC1 388 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dchs1E9PVD3 3291 aa20.79■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 2410141K09RikK7N769 464 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccrl2O35457 360 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Emp3O35912 163 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hcn1O88704 910 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P01635 115 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P01638 115 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 H2-LP01897 362 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Il5raP21183 415 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmem173Q3TBT3 378 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 HgsnatQ3UDW8 656 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cobll1Q3UMF0 1273 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rassf5Q5EBH1 413 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cd34Q64314 382 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pp2d1Q8BVT6 620 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gramd4Q8CB44 633 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 BlmhQ8R016 455 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MlycdQ99J39 492 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 OoepQ9CWE6 164 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fbxl20Q9CZV8 436 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ing2Q9ESK4 281 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fbxw5Q9QXW2 573 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rgs20Q9QZB1 239 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Crlf3Q9Z2L7 442 aa20.78■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Akap9Q70FJ1 3797 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zfp873A0A1B0GT64 667 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AgmatA2AS89 358 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ptrhd1D3Z4S3 140 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Vmn2r92L7N2A4 860 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 RfngO09009 332 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 B3galt2O54905 422 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Icam1P13597 537 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pou4f1P17208 421 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Surf6P70279 355 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PhexP70669 749 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atp5jP97450 108 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam117bQ3U3E2 584 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf260Q62513 407 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Q8K039 155 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Olfr380Q8VGT3 311 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 TesclQ9DAJ7 231 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa20.77■□□□□ 0.92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm11634A0A1B0GSX1 172 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smok3aC0HKC8 504 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smok3bC0HKC9 504 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Omt2aF6ZJR3 104 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 H3BKT1 185 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gap43P06837 227 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccr2P51683 373 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gfi1P70338 423 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rit1P70426 219 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rgs14P97492 547 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Grxcr2Q3TYR5 254 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fzd7Q61090 572 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rfwd3Q8CIK8 774 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Spin4Q8K1L2 249 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Clrn1Q8K445 232 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 B4galt7Q8R087 327 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc29a4Q8R139 528 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Vmn1r24Q8R2D6 296 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Olfr693Q8VF89 316 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Wasf3Q8VHI6 501 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Homer3Q99JP6 356 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NarfQ9CYQ7 462 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Maf1Q9D0U6 258 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Klhl1Q9JI74 751 aa20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 A6H6Q4 206 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kcnk16G5E845 292 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sult3a2G5E904 293 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rundc3aO08576 446 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ninj1O70131 152 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P01629 112 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nme1P15532 152 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trim30aP15533 496 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 IapP24822 559 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nr2f6P43136 390 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Six5P70178 719 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmem64Q3U145 381 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Olfr3Q60879 313 aa20.75■□□□□ 0.91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pkp4Q68FH0 1190 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.1 ms