RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	RHCE	P18577	417 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PRPS1L1	P21108	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	AKR1D1	P51857	326 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	DSC2	Q02487	901 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPRN	Q16849	979 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PANX1	Q96RD7	426 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CLDN5	O00501	218 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	FFAR2	O15552	330 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ITGA10	O75578	1167 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	LPL	P06858	475 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	NR2F6	P10588	404 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	DRD2	P14416	443 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	GSTM5	P46439	218 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PIK3CG	P48736	1102 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TTPA	P49638	278 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR17	Q13304	367 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	IHH	Q14623	411 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MICB	Q29980	383 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SBSN	Q6UWP8	590 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC6A18	Q96N87	628 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PKMYT1	Q99640	499 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PIP5K1A	Q99755	562 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958		D6RAR5	112 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PRAF2	O60831	178 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OSM	P13725	252 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CD52	P31358	61 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	XCR1	P46094	333 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	AVPR1B	P47901	424 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CTBP2	P56545	445 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC38A3	Q99624	504 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MED10	Q9BTT4	135 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MLX	Q9UH92	298 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	IRAK2	O43187	625 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SSX5	O60225	188 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SMIM6	P0DI80	62 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CCL5	P13501	91 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SDC1	P18827	310 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ITK	Q08881	620 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	HFE	Q30201	348 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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