RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 CGREF1Q99674 301 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 CENPKQ9BS16 269 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 AICDAQ9GZX7 198 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 KLHL31Q9H511 634 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 C1orf109Q9NX04 203 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 CTSFQ9UBX1 484 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 PPT2Q9UMR5 302 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.31□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 C7orf72A4D263 438 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 XCR1P46094 333 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 SYT16Q17RD7 645 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 MTX3Q5HYI7 312 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 KCNC2Q96PR1 638 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 CHST10O43529 356 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 HEXBP07686 556 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 FCGR1AP12314 374 aa8.29□□□□□ -1.08
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SMAD4-217ENST00000611848 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SMAD4-217ENST00000611848 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.29□□□□□ -1.08
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