RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A5Q9Y345 797 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0A6YYD5 115 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC6AO75865 159 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM155BO75949 473 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSL3O95573 720 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 IL2RAP01589 272 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2F6P10588 404 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SSTR4P31391 388 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK9P50750 372 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KA2Q15349 733 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC7Q5VTL7 733 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMKMTQ7Z624 323 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TAGAPQ8N103 731 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX9Q8N6V9 391 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SPPL2AQ8TCT8 520 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RILPQ96NA2 401 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC188H7C350 402 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ATE1O95260 518 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 HPNP05981 417 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MTHFD2P13995 350 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 EPB42P16452 691 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 BSGP35613 385 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 DCST1Q5T197 706 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPH1Q70E73 1250 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 PM20D2Q8IYS1 436 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPBAP1Q96EW2 488 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GNRHR2Q96P88 292 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 NMRAL1Q9HBL8 299 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK2AQ9UQM7 478 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf41Q9Y2V0 281 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBAL3A6NHL2 446 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53I11O14683 189 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 AIFM1O95831 613 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RAF1P04049 648 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM58BPP0C7Q3 252 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FOSL1P15407 271 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ACANP16112 2415 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNSP34059 522 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GPX6P59796 221 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SLMAPQ14BN4 828 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 VASNQ6EMK4 673 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CYS1Q717R9 158 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01560Q8TB33 94 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIB1Q96RU8 372 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL4Q9BY76 406 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX15Q9NRS6 342 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX4O95219 450 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35E2P0CK97 266 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 EPXP11678 715 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 DRD2P14416 443 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRP35270 261 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ARFIP1P53367 373 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB113Q30KQ7 82 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 EIPR1Q53HC9 387 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 WFDC11Q8NEX6 87 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53INP1Q96A56 240 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2B28Q9BY64 529 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 DPH5Q9H2P9 285 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR8Q9H981 624 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf21Q9HAI6 301 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA4P78363 2273 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC14BA6NHZ5 514 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CD8B2A6NJW9 211 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN14A8MX76 684 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GBAP04062 536 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CT62P0C5K7 136 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP7P18075 431 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 MASP1P48740 699 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NHSL2Q5HYW2 709 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GRTP1Q5TC63 336 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPJQ5W064 366 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP20A1Q6UW02 462 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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