RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A087WW49	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SAP30	O75446	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLN5	O75503	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CEACAM1	P13688	526 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	DNAJB1	P25685	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR3A2	P47893	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMS	P52788	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRKAB2	O43741	272 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GAS8	O95995	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	AADAC	P22760	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLCN4	P51793	760 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CDH18	Q13634	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	DUSP5	Q16690	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GBF1	Q92538	1859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF292	O60281	2723 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A087WZ39	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	SYCE3	A1L190	88 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC1A7	O00341	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF195	O14628	629 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	MLNR	O43193	412 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	PI15	O43692	258 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	ABHD2	P08910	425 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	GNB3	P16520	340 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	TYMP	P19971	482 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	CTNNA2	P26232	953 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC1A3	P43003	542 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC1A4	P43007	532 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	NOV	P48745	357 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	CSNK2B	P67870	215 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEDD4L-231	ENST00000590694	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms