RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 CT62P0C5K7 136 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 KCNC1P48547 511 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 HSPA7P48741 367 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TAS2R39P59534 338 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TNK1Q13470 666 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 VWA1Q6PCB0 445 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 KCNC2Q96PR1 638 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GSX2Q9BZM3 304 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 OR51B5Q9H339 312 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GLOD5A6NK44 160 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 B4DXG7 233 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SOX30O94993 753 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MASP1P48740 699 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SLAMF1Q13291 335 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RPS6KA2Q15349 733 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GALNT7Q86SF2 657 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RDH11Q8TC12 318 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 WDR34Q96EX3 536 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PNV4 684 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PIAS1O75925 651 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PLAUP00749 431 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 C8BP07358 591 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CYP4B1P13584 511 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 COX7A2P14406 83 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CPN1P15169 458 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CRYGSP22914 178 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GSTM2P28161 218 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MC3RP41968 323 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 RCN2Q14257 317 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TGFBIQ15582 683 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 STARD4Q96DR4 205 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NODALQ96S42 347 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SERHLQ9NQF3 203 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 HEY2Q9UBP5 337 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ROS1P08922 2347 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRS-208ENST00000590509 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 C17orf51A8MQB3 221 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 CLGNO14967 610 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 SSR2P43308 183 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 HNMTP50135 292 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PLIN5Q00G26 463 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 TNFRSF17Q02223 184 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 RCAN2Q14206 197 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 TBCELQ5QJ74 424 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 SNX31Q8N9S9 440 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 CFAP36Q96G28 342 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 EHD1Q9H4M9 534 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 FETUBQ9UGM5 382 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PR48 441 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 RNF223E7ERA6 249 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 H0Y3Z8 333 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 CES2O00748 559 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PLPP1O14494 284 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 TMPRSS11DO60235 418 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRS-208ENST00000590509 SNX4O95219 450 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms