RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RELL1	Q8IUW5	271 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FBF1	Q8TES7	1133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TANK	Q92844	425 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF358	Q9NW07	568 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PHF11	Q9UIL8	331 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	OR10H2	O60403	315 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GPR75	O95800	540 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	MAGEA4	P43358	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PIK3CG	P48736	1102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NEK2	P51955	445 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FBXW4	P57775	412 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NAB1	Q13506	487 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NTRK2	Q16620	822 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SLC15A4	Q8N697	577 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RIT1	Q92963	219 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ART5	Q96L15	291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DOHH	Q9BU89	302 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422		H0YIV9	168 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PGRMC2	O15173	223 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DYRK3	O43781	588 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CT62	P0C5K7	136 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GFAP	P14136	432 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GABRA1	P14867	456 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GDF1	P27539	372 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CRABP2	P29373	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SERPINB3	P29508	390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	STX2	P32856	288 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DUSP8	Q13202	625 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GPR78	Q96P69	363 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CDK15	Q96Q40	435 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SNX15	Q9NRS6	342 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	C2	P06681	752 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	BMP5	P22003	454 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	UQCRC1	P31930	480 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CUL3	Q13618	768 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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