RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAMEF2O60811 474 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS4BO75351 444 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV3-11P04433 115 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SP1P08047 785 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 KITP10721 976 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CD46P15529 392 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 S1PR1P21453 382 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPH2P23942 346 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNSP34059 522 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MPIP34949 423 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CYB561P49447 251 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 HLCSP50747 726 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SSR4P51571 173 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 HK2P52789 917 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC18A1P54219 525 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC37A1P57057 533 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MGAT2Q10469 447 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP4K2Q12851 820 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF766Q5HY98 468 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 IL23RQ5VWK5 629 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ATG16L1Q676U5 607 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 HOMEZQ8IX15 550 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GRHL3Q8TE85 626 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ASB15Q8WXK1 588 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 KAT2AQ92830 837 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXL20Q96IG2 436 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ART5Q96L15 291 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF681Q96N22 645 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 TSSK3Q96PN8 268 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SORT1Q99523 831 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf50Q9BV19 199 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF32Q9H0A6 362 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR10A5Q9H207 317 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MYOTQ9UBF9 498 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS4AQ9UN37 437 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SASH3O75995 380 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NEURL1O76050 574 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6B1O95007 311 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 RASAL1O95294 804 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 CLPSP04118 112 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 BCKDHAP12694 445 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 PCSK2P16519 638 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SDC1P18827 310 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 DDCP20711 480 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SOX18P35713 384 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 SOX3P41225 446 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 GSTM5P46439 218 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms