RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRR3A8MPY1 467 aa30.82■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAT2BQ9NZL9 334 aa30.8■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STON2Q8WXE9 905 aa30.77■■■□□ 2.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A7Q92504 469 aa30.77■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ERP27Q96DN0 273 aa30.77■■■□□ 2.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDCP1Q9H5V8 836 aa30.77■■■□□ 2.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD28O15084 1053 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLITRK5O94991 958 aa30.76■■■□□ 2.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 VIMP08670 466 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
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