RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RAB33BQ9H082 229 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 VCX3BQ9H321 246 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 IL21RQ9HBE5 538 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RAB23Q9ULC3 237 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 AURKCQ9UQB9 309 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 A0A1B0GVT2 93 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 H3BMH7 237 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 GSTA4O15217 222 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CLOCKO15516 846 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 TPST1O60507 370 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 UBXN7O94888 489 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RASAL1O95294 804 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 KRT75O95678 551 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 LDLRP01130 860 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 MT-ND1P03886 318 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 NTRK1P04629 796 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 PROS1P07225 676 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 ADH7P40394 386 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RAD52P43351 418 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CAPZBP47756 277 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 ALDH9A1P49189 494 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 LIM2P55344 173 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 BTN3A2P78410 334 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 TNFRSF17Q02223 184 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CFHR1Q03591 330 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 FOLH1Q04609 750 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RGS1Q08116 209 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 TGM3Q08188 693 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 BNIP3Q12983 259 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 FADDQ13158 208 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 MYBPC3Q14896 1274 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 NR1D2Q14995 579 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 PMS2CLQ68D20 193 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 IRGCQ6NXR0 463 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 TMEM64Q6YI46 380 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 GALNT10Q86SR1 603 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RNF130Q86XS8 419 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 MAL2Q969L2 176 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 FAM162AQ96A26 154 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 C7orf34Q96L11 122 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 RNF145Q96MT1 663 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SEPHS2Q99611 448 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 CIB1Q99828 191 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 LYRM4Q9HD34 91 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 BRD7Q9NPI1 651 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 VNN3Q9NY84 501 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 NTMQ9P121 344 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPN3-210ENST00000561817 NCDNQ9UBB6 729 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms