RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559770.1

MFGE8-211, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-211ENST00000559770 ERVK-8P63133 956 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 EMC4Q5J8M3 183 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 GK5Q6ZS86 529 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 CD163Q86VB7 1156 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 KIF18AQ8NI77 898 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 DOK4Q8TEW6 326 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ERVK-6Q9BXR3 956 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF225Q9UK10 706 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 NFU1Q9UMS0 254 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ERVK-19Q9WJR5 959 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 DNAJC13O75165 2243 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 A0A1B0GVC2 190 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 OR6C76A6NM76 312 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 FAM166BA8MTA8 275 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ACOT7O00154 380 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 PDE9AO76083 593 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 TPOP07202 933 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 DNASE1L1P49184 302 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 PLGLB1Q02325 96 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 SLC22A16Q86VW1 577 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 EID3Q8N140 333 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 METTL4Q8N3J2 472 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 SLC22A8Q8TCC7 542 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 RIT1Q92963 219 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 CNPPD1Q9BV87 410 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 WDR41Q9HAD4 459 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 PROK2Q9HC23 129 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM216Q9P0N5 145 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-211ENST00000559770 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 RIPK2O43353 540 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 OR10H2O60403 315 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 OTCP00480 354 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 P04436 131 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 KLK1P06870 262 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 FBXO45P0C2W1 286 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 CT62P0C5K7 136 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 HSD17B3P37058 310 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 PIGAP37287 484 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 MAGEA5P43359 124 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 CDH13P55290 713 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 FUT7Q11130 342 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 IFT88Q13099 833 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 PAOXQ6QHF9 649 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 SLC29A4Q7RTT9 530 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 CEP112Q8N8E3 955 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 NINJ1Q92982 152 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 MTBPQ96DY7 904 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 BRF2Q9HAW0 419 aa11.89□□□□□ -0.51
MFGE8-211ENST00000559770 AHSPQ9NZD4 102 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms