RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZNF721Q8TF20 911 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SARAFQ96BY9 339 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 FBXL8Q96CD0 374 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HAUS8Q9BT25 410 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 LDAHQ9H6V9 325 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 JKAMPQ9P055 326 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ABCA1O95477 2261 aa7.25□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HSPB2A8KAH6 182 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CLPSP04118 112 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 IGKV3-11P04433 115 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SERPINA6P08185 405 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MED14OSP0DP75 135 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CD22P20273 847 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CCND1P24385 295 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ECHS1P30084 290 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLCO1A2P46721 670 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 LIM2P55344 173 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HSD17B7P56937 341 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLC7A5Q01650 507 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ASPHQ12797 758 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLC13A2Q13183 592 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLC10A1Q14973 349 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HSPB2Q16082 182 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CASC4Q6P4E1 433 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HSDL2Q6YN16 418 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MNS1Q8NEH6 495 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ISL2Q96A47 359 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SERPINB12Q96P63 405 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CCDC77Q9BR77 488 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 EXO5Q9H790 373 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PELI2Q9HAT8 420 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ARL15Q9NXU5 204 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GALNT8Q9NY28 637 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 A0A1W2PS29 197 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 LRIT2A6NDA9 550 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 C17orf105B2RV13 164 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CDC7O00311 574 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 DVL2O14641 736 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 FGF17O60258 216 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 EPPINO95925 133 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 KRT14P02533 472 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 P04436 131 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GABRA1P14867 456 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PAMP19021 973 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SAT1P21673 171 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GDF5P43026 501 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PLA2G16P53816 162 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 LINC00310P59036 64 aa7.23□□□□□ -1.25
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