RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	RHOBTB1	O94844	696 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GLCE	O94923	617 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM16	O95361	564 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TSHB	P01222	138 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC192	P0DO97	292 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PRKAR1A	P10644	381 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CPA3	P15088	417 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	STMN1	P16949	149 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PSMA5	P28066	241 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MYL7	Q01449	175 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GCNT1	Q02742	428 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ARL16	Q0P5N6	197 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CBX3	Q13185	183 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DRP2	Q13474	957 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NECTIN1	Q15223	517 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MAPK6	Q16659	721 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GTDC1	Q4AE62	458 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TBCK	Q8TEA7	893 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	BTBD9	Q96Q07	612 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PKP4	Q99569	1192 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NDN	Q99608	321 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	LXN	Q9BS40	222 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TCHH	Q07283	1943 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1B0GUA9	196 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1B0GUV1	79 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SYCE3	A1L190	88 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FAM172BP	A6NC97	362 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	FPGT	O14772	594 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	KRT36	O76013	467 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	B3GAT3	O94766	335 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	STBD1	O95210	358 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	LYPLA2	O95372	231 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DEXI	O95424	95 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CEACAM1	P13688	526 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	F3	P13726	295 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PAX1	P15863	534 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GDI1	P31150	447 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	OR1D2	P34982	312 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DCT	P40126	519 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CASP3	P42574	277 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	IER3	P46695	156 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	KHK	P50053	298 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	DNA2	P51530	1060 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NPRL3	Q12980	569 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	STPG1	Q5TH74	334 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ITIH5	Q86UX2	942 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	BLID	Q8IZY5	108 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ERMN	Q8TAM6	284 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ITFG1	Q8TB96	612 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	LMLN	Q96KR4	655 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TSSK2	Q96PF2	358 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF559	Q9BR84	538 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82

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