RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MUC3AQ02505 3323 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRP2P98164 4655 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 BRCA2P51587 3418 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDRT15L2A8MXV6 281 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 J3QRE1 110 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR7A17O14581 309 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 B4GAT1O43505 415 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR2C1O95371 312 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 GOT2P00505 430 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PGK1P00558 417 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CD59P13987 128 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 HTR1EP28566 365 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSD17B3P37058 310 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 HADHAP40939 763 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR3A3P47888 321 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC7A2P52569 658 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CACNG7P62955 275 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 DPYSL3Q14195 570 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 BECN1Q14457 450 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPA1Q15181 289 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 IRF4Q15306 451 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNAPC1Q16533 368 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACER2Q5QJU3 275 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MFSD7Q6UXD7 560 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CYP26C1Q6V0L0 522 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 COX8CQ7Z4L0 72 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLFN11Q7Z7L1 901 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 HEATR4Q86WZ0 1026 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CROCCP3Q8IVE0 287 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF595Q8IYB9 648 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CAMKVQ8NCB2 501 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ICA1LQ8NDH6 482 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 STARD8Q92502 1023 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM210BQ96KR6 192 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 GUCD1Q96NT3 240 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMIM14Q96QK8 99 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PAFAH2Q99487 392 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNX25Q9H3E2 840 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 IL1RL2Q9HB29 575 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MMP26Q9NRE1 261 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MRGBPQ9NV56 204 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MED17Q9NVC6 651 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDP2Q9P2J9 529 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF225Q9UK10 706 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CEP290O15078 2479 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 LAMA5O15230 3695 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CELSR2Q9HCU4 2923 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 FRMPD3Q5JV73 1810 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 LTBP4Q8N2S1 1624 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa0.13□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ITPR2Q14571 2701 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CADP27708 2225 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MYO7AQ13402 2215 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 LOC100509620A0A075B734 347 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 A6NLC8 198 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PGRMC2O15173 223 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLXNB1O43157 2135 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 INSP01308 110 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CSN3P07498 182 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PVRP15151 417 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 EPORP19235 508 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 HNF1AP20823 631 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 IDSP22304 550 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NPY1RP25929 384 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 DUTP33316 252 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TFPI2P48307 235 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TUBP50607 506 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCR6P51684 374 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLDN15P56746 228 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP12-1P59990 96 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 UBXN2AP68543 259 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SULT2A1Q06520 285 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 DNLZQ5SXM8 178 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 APOOLQ6UXV4 268 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ERICH1Q86X53 443 aa0.12□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 UNC5CLQ8IV45 518 aa0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms