RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA7Q9P0W8 599 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 NLKQ9UBE8 527 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 UPB1Q9UBR1 384 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 SLC24A2Q9UI40 661 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 CD84Q9UIB8 345 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 TEKT2Q9UIF3 430 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 KLK4Q9Y5K2 254 aa4□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 SDK2Q58EX2 2172 aa4□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 NDUFA9Q16795 377 aa3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.99□□□□□ -1.77
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HDAC2-216ENST00000523628 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 BFARQ9NZS9 450 aa3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 ABI3Q9P2A4 366 aa3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.99□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JK05 382 aa3.98□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.98□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GUH1 482 aa3.98□□□□□ -1.77
HDAC2-216ENST00000523628 DYTNA2CJ06 578 aa3.98□□□□□ -1.77
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