RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517194.1

RNU6-1261P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1261, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1261P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HTD2P86397 168 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NME3Q13232 169 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 IL23RQ5VWK5 629 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DOK6Q6PKX4 331 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 OLFM4Q6UX06 510 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GPR142Q7Z601 462 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ADCK1Q86TW2 530 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 AMZ2Q86W34 360 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MLKLQ8NB16 471 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 LRRC15Q8TF66 581 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FCGR1BQ92637 280 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SLC45A3Q96JT2 553 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 LIME1Q9H400 295 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HPF1Q9NWY4 346 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ATP8B3O60423 1300 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 A8MXK9 166 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PDHXO00330 501 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DCXO43602 365 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 AKR7A3O95154 331 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TRIM16O95361 564 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 OR9G9P0C7N8 305 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CYP11B1P15538 503 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PTMSP20962 102 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PTPN4P29074 926 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRDX2P32119 198 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CAPGP40121 348 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ATP4BP51164 291 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GPC3P51654 580 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ERVK11-1P61568 191 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SNX1Q13596 522 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PDIA5Q14554 519 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 EMC2Q15006 297 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HKDC1Q2TB90 917 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 UNC50Q53HI1 259 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MUC21Q5SSG8 566 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 C12orf60Q5U649 245 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SYVN1Q86TM6 617 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RPAINQ86UA6 219 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ERC1Q8IUD2 1116 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 LRRC61Q9BV99 259 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MUTYHQ9UIF7 546 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SALL1Q9NSC2 1324 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 K7ERI5 159 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HPRP00739 348 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 IGHG1P01857 330 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FOSL2P15408 326 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MT3P25713 68 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MATKP42679 507 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MAGEA4P43358 317 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RAG2P55895 527 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FUT7Q11130 342 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ENPP2Q13822 863 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HAGHQ16775 308 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RNF130Q86XS8 419 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PYROXD2Q8N2H3 581 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms