RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516299.1

RNU6-1232P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1232, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1232P, Length 86 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EI24O14681 340 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SIGLEC5O15389 551 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ANGPTL7O43827 346 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZWINTO95229 277 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 VENTXO95231 258 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GNA14O95837 355 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SCGB1D2O95969 90 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IGHG3P01860 377 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC4A1P02730 911 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MYL1P05976 194 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 APRTP07741 180 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 P0C880 135 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 STAG3L1P0CL83 205 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LAMP1P11279 417 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 UBL4AP11441 157 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 POU2F1P14859 743 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF250P15622 560 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PGAM1P18669 254 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CPT2P23786 658 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DNASE1P24855 282 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 G6PCP35575 357 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 BSGP35613 385 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ARL3P36405 182 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CX3CR1P49238 355 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 UBE2AP49459 152 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CCR6P51684 374 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TKTL1P51854 596 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PRKAA2P54646 552 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PRMT2P55345 433 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CLDN17P56750 224 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NOP14P78316 857 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IL9RQ01113 521 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GALK2Q01415 458 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ACSM1Q08AH1 577 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF415Q09FC8 603 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC10A7Q0GE19 358 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CNTN1Q12860 1018 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ABRQ12979 859 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IHHQ14623 411 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TRADDQ15628 312 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MAPK11Q15759 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EXT1Q16394 746 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CAMK4Q16566 473 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CA9Q16790 459 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LRRC36Q1X8D7 754 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 XKR7Q5GH72 579 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 OR2B11Q5JQS5 317 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PAGE3Q5JUK9 113 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SPANXN4Q5MJ08 99 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FAM46CQ5VWP2 391 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZFAND6Q6FIF0 208 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ADNP2Q6IQ32 1131 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 HCP5Q6MZN7 132 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GIMAP6Q6P9H5 292 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DHRS11Q6UWP2 260 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 STOX1Q6ZVD7 989 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CPLX4Q7Z7G2 160 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NLRP14Q86W24 1093 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CROCCP3Q8IVE0 287 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 C4orf19Q8IY42 314 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MMD2Q8IY49 270 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF683Q8IZ20 524 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SCYL3Q8IZE3 742 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PGAM4Q8N0Y7 254 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TEX26Q8N6G2 289 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TMEM252Q8N6L7 170 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LRRC52Q8N7C0 313 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GVQW1Q8N7I0 195 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TEX19Q8NA77 164 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SUMF2Q8NBJ7 301 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 APCDD1LQ8NCL9 501 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NAXEQ8NCW5 288 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 OR13C5Q8NGS8 318 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GOLGA5Q8TBA6 731 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MCOLN3Q8TDD5 553 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SELENOMQ8WWX9 145 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SEPT1Q8WYJ6 367 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PIGBQ92521 554 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms