RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CES3Q6UWW8 571 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR142Q7Z601 462 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 STKLD1Q8NE28 680 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPNS2Q96L46 248 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TSPY26PQ9H489 355 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR76Q9H967 626 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 STARD5Q9NSY2 213 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TCF19Q9Y242 345 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 HHLA1C9JL84 531 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 INPP4BO15327 924 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 STK17BO94768 372 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM23P36406 574 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MMP12P39900 470 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SGSHP51688 502 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ITPK1Q13572 414 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF699Q32M78 642 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NADK2Q4G0N4 442 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GPBP1Q86WP2 473 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GIPC3Q8TF64 312 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 F2RL3Q96RI0 385 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 DCTPP1Q9H773 170 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NMUR1Q9HB89 426 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 G3V2L1 256 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MCF2LO15068 1137 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GMFGO60234 142 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ASNSP08243 561 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 DRD5P21918 477 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC1A6P48664 564 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 HAGHQ16775 308 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 HLA-BQ31612 363 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC36A3Q495N2 470 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF876PQ49A33 203 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM110Q86TL2 294 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RMND5AQ9H871 391 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SNX6Q9UNH7 406 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 K7EQD1 137 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIP10Q15642 601 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PARP6Q2NL67 630 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NIPAL3Q6P499 406 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CASC1Q6TDU7 716 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MED20Q9H944 212 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RDH8Q9NYR8 311 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CLRN2A0PK11 232 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MEIOCA2RUB1 952 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF724A8MTY0 619 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CFLARO15519 480 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MFN2O95140 757 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 NXPH2O95156 264 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms