RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP6C	O00743	305 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PGRMC2	O15173	223 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC19A2	O60779	497 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA7A	O75326	666 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK1	P28482	360 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NTS	P30990	170 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	GCK	P35557	465 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINB5	P36952	375 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TDGF1P3	P51864	188 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ2	P63252	427 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGG	Q5H8A4	983 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	HES7	Q9BYE0	225 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	AZIN1	O14977	448 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NPHS1	O60500	1241 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC22B	O75396	215 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SLITRK5	O94991	958 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6B1	O95007	311 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV3-11	P04433	115 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP1B1	P05026	303 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	IL3	P08700	152 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MST1	P26927	711 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CA7	P43166	264 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MASP1	P48740	699 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC37A1	P57057	533 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR85	P60893	370 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGCS1	Q01581	520 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf80	Q0P641	193 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM198	Q66K66	360 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TRABD2A	Q86V40	505 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	LIX1	Q8N485	282 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MREG	Q8N565	214 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	RELT	Q969Z4	430 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CCT7	Q99832	543 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ACPT	Q9BZG2	426 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	EHD3	Q9NZN3	535 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM114	B3SHH9	223 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ACOX3	O15254	700 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	COQ9	O75208	318 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SPAG7	O75391	227 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	LDLR	P01130	860 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TPO	P07202	933 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PTGS2	P35354	604 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FUT7	Q11130	342 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP4K2	Q12851	820 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS6KA2	Q15349	733 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73

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