RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 GPX3P22352 226 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 NTSP30990 170 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 S100A3P33764 101 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 KIR3DL1P43629 444 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CCL11P51671 97 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CLCN2P51788 898 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PGDP52209 483 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.22e-7■□□□□ 11.2
ABCD4-216ENST00000493752 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 NME5P56597 212 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 STX1BP61266 288 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 DUSP2Q05923 314 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 FUT7Q11130 342 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SQLEQ14534 574 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MPEG1Q2M385 716 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 BTBD16Q32M84 506 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PGS1Q32NB8 556 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF385BQ569K4 471 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.58□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 GALNT16Q8N428 558 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.58□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 OR8K3Q8NH51 312 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF675Q8TD23 568 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF721Q8TF20 911 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 NUDT8Q8WV74 236 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 C10orf82Q8WW14 230 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 OR5P2Q8WZ92 322 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 VMP1Q96GC9 406 aa7.58□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MARK4Q96L34 752 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 TEX37Q96LM6 180 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 DUSP26Q9BV47 211 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 LHPPQ9H008 270 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF639Q9UID6 485 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.58□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 A0A087WV62 115 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 FAM234BA2RU67 622 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 MASP2O00187 686 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PLOD3O60568 738 aa7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZFAND5O76080 213 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PGRP06401 933 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ITGA3P26006 1051 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 IL12AP29459 219 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 WNT3P56703 355 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 PHC1P78364 1004 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 RHDQ02161 417 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 LRRC74AQ0VAA2 488 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.57□□□□□ -1.2
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ABCD4-216ENST00000493752 NCLNQ969V3 563 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 ELP4Q96EB1 424 aa7.57□□□□□ -1.2
ABCD4-216ENST00000493752 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.57□□□□□ -1.2
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