RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489077.1

AC004889.1-208, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC004889.1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-208ENST00000489077 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 PROM1O43490 865 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SMPD2O60906 423 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SNX4O95219 450 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ETHE1O95571 254 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ACSL3O95573 720 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 INHBBP09529 407 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SMIM10L1P0DMW3 83 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 EPXP11678 715 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 NT5EP21589 574 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 PIK3R1P27986 724 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 KRT20P35900 424 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 PAFAH1B1P43034 410 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC6A12P48065 614 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 DLX5P56178 289 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 WNT3P56703 355 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TAS2R39P59534 338 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 DCAF7P61962 342 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TNFRSF17Q02223 184 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 BIKQ13323 160 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 CYP1B1Q16678 543 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 RTL6Q6ICC9 239 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 KLC3Q6P597 504 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SCIMPQ6UWF3 145 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC25Q86WR0 208 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 NUDT13Q86X67 352 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 GALNT12Q8IXK2 581 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC35F6Q8N357 371 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ACBD4Q8NC06 268 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 BBOF1Q8ND07 529 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 LINC01560Q8TB33 94 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 STAG3L4Q8TBR4 150 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 RDH11Q8TC12 318 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ACTRT1Q8TDG2 376 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF721Q8TF20 911 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SMIM10Q96HG1 83 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 FBXL20Q96IG2 436 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 C18orf12Q96KH6 178 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 QRFPRQ96P65 431 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 DERL2Q9GZP9 239 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 WWTR1Q9GZV5 400 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 EPB41L4BQ9H329 900 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 OR51B5Q9H339 312 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ALG9Q9H6U8 611 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 NT5DC2Q9H857 520 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 CAB39LQ9H9S4 337 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF358Q9NW07 568 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SENP1Q9P0U3 644 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 DKKL1Q9UK85 242 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 CBLCQ9ULV8 474 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 PSAT1Q9Y617 370 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa4.96□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 AKAP9Q99996 3911 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SH3D21A4FU49 640 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 GOLGA6L10A6NI86 522 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 K7EPI3 171 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 SYT5O00445 386 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 CDH16O75309 829 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 GUCY1B2O75343 617 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 GOSR1O95249 250 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 ESRRBO95718 433 aa4.95□□□□□ -1.62
AC004889.1-208ENST00000489077 EPPINO95925 133 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms