RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	DCAF10	Q5QP82	559 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	WDR93	Q6P2C0	686 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	SARM1	Q6SZW1	724 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q6ZS92	163 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	PID1	Q7Z2X4	250 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	HM13	Q8TCT9	377 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	LCN9	Q8WX39	176 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	TM9SF4	Q92544	642 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTER	Q96BW5	349 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPM1M	Q96MI6	270 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASB8	Q9H765	288 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	LUZP4	Q9P127	313 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	3.77	□□□□□ -1.81	7e-10	■□□□□ 9.3
SNRNP40-205	ENST00000486941	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCN2A	Q99250	2005 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	GSAP	A4D1B5	854 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	C2orf74	A8MZ97	194 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	HACD1	B0YJ81	288 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941		H3BMH7	237 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	LDB2	O43679	373 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	CST8	O60676	142 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR2B3	O76000	313 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANXA9	O76027	345 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	AGT	P01019	485 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	GYPC	P04921	128 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	OTX2	P32243	289 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	GABRA4	P48169	554 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	LMAN1	P49257	510 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRLHR	P49683	370 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	GEM	P55040	296 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	DLX5	P56178	289 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	DYNLT1	P63172	113 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	TPM4	P67936	248 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	XIAP	P98170	497 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPA4	Q13156	261 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	PMS2P11	Q13670	270 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAPSN	Q13702	412 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTPRCAP	Q14761	206 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	KYNU	Q16719	465 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR33	Q49SQ1	333 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	MLIP	Q5VWP3	458 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPESP1	Q6UW49	350 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	DET1	Q7L5Y6	550 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNX20	Q7Z614	316 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOOK3	Q86VS8	718 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNMB4	Q86W47	210 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF567	Q8N184	647 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	IPMK	Q8NFU5	416 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81

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