RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGAP11Q8TF27 550 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR137Q96N19 417 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITPR3Q14573 2671 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 HIVEP1P15822 2718 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PDZD2O15018 2839 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 GAGE10A6NGK3 116 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR51F1A6NGY5 319 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TARM1B6A8C7 271 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRRG2O14669 202 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CTSVO60911 334 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSPAN12O95859 305 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 APOA4P06727 396 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELANEP08246 267 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSMB5P28074 263 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITIH4Q14624 930 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAF11Q15544 211 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAZQ16635 292 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MLANAQ16655 118 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 BEST3Q8N1M1 668 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 GHDCQ8N2G8 530 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.65□□□□□ -1.34
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APOBEC3G-206ENST00000486357 RNFT2Q96EX2 444 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 NPAS1Q99742 590 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF559Q9BR84 538 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNK13Q9HB14 408 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRGBPQ9NV56 204 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZFHX3Q15911 3703 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.64□□□□□ -1.35
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APOBEC3G-206ENST00000486357 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTGES3LE9PB15 166 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 F5H697 171 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 H0YGG7 62 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSTPIP1O43586 416 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR1I1O60431 355 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MFAP3LO75121 409 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GYPCP04921 128 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM225BP0DP42 221 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CMPK1P30085 196 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSF1Q00613 529 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYBPHQ13203 477 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMED2Q15363 201 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR1C1Q15619 314 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYT16Q17RD7 645 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACER2Q5QJU3 275 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CES4AQ5XG92 561 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPINK14Q6IE38 97 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PACS1Q6VY07 963 aa6.64□□□□□ -1.35
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